食品安全法執(zhí)法檢查組對各地方、各方面反映的困難和問題、提出的建議，概括為七個方面：
1、監(jiān)管體制改革尚未到位
2、配套法規(guī)、規(guī)章仍滯后
3、安全風險監(jiān)測基礎薄弱
4、安全標準數(shù)量少指標粗
5、經(jīng)費問題影響執(zhí)法效果
6、部分企業(yè)未能落實責任
7、普法宣傳社會監(jiān)督不夠
全國人大常委會罕見地對一部法律當年實施、當年即開展執(zhí)法檢查。
食品安全法這部法律在立法過程中就備受關注，全國人大常委會副委員長路甬祥昨日作執(zhí)法檢查報告時表示，“各級黨政領導從來沒有像今天這樣重視食品安全工作，社會公眾從來沒有像今天這樣關注食品安全。”
執(zhí)法檢查組認為法律實施總體情況良好。不過，向來講問題和建議多于成績的人大執(zhí)法檢查報告，也指出了目前食品安全法實施中涉及的七大問題。
綜合協(xié)調(diào)機制待完善
分段監(jiān)管的體制問題在食品安全法制訂過程中即有很多批評，執(zhí)法檢查組發(fā)現(xiàn)，監(jiān)管體制改革尚未到位———省級機構(gòu)改革正在進行，監(jiān)管職能調(diào)整沒有完成，大多數(shù)市、縣級體制改革還未啟動。
而國務院衛(wèi)生行政部門履行食品安全綜合協(xié)調(diào)職責的工作機制尚待進一步完善，目前尚未建立起強有力的工作機制。
此前法律制訂中，分段監(jiān)管體制中的不同部門監(jiān)管界限不清晰的問題就已提出，此次執(zhí)法檢查發(fā)現(xiàn)依然存在監(jiān)管邊界不夠清晰問題。
配套法規(guī)規(guī)章仍滯后
執(zhí)法檢查組發(fā)現(xiàn)，由于食品安全法頒布實施時間不長，目前配套法規(guī)、規(guī)章滯后的問題仍然比較突出。比如保健食品監(jiān)管、食品生產(chǎn)許可等方面的配套法規(guī)規(guī)章至今沒有出臺。
此外，雖然食品安全法授權(quán)省級人大常委會制定本區(qū)域內(nèi)食品生產(chǎn)加工小作坊和食品攤販的具體管理辦法，但地方立法難度大，至今絕大多數(shù)省份還沒有制定這方面的地方性法規(guī)。
目前，食品安全風險監(jiān)測、風險評估與預警工作基礎薄弱，對食源性疾病、食品污染和食品中有害因素的風險監(jiān)測與評估尚處于起步階段，路甬祥表示，各地工作開展不平衡，與食品安全法確定的實施風險監(jiān)測與評估制度還有較大差距。
檢查組建議有關部門加快建立覆蓋全國的風險監(jiān)測網(wǎng)絡，加快組建國家食品安全風險評估中心，在有能力的地區(qū)建立風險評估分中心。
中西部經(jīng)費缺口較大
食品安全法實施條例規(guī)定了買樣費和檢驗費由同級財政列支，國務院也要求縣級以上地方人民政府對本行政區(qū)域內(nèi)執(zhí)行食品安全法確立的各項制度予以經(jīng)費保障，但是中西部和其他困難地區(qū)財政經(jīng)費到位率很低，缺口很大，直接導致監(jiān)督抽檢范圍縮小、頻率下降、批次減少，影響了執(zhí)法的效果。
此外，執(zhí)法檢查組還就食品安全標準缺乏和不統(tǒng)一，企業(yè)作為食品安全“*責任人”意識不強，社會監(jiān)督渠道不暢等問題提出了建議。執(zhí)法檢查組建議全國人大常委會于2011年再次開展食品安全法的執(zhí)法檢查，以促進法律的有效實施，切實改進食品安全狀況
